Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5415E9PXF3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.4 ms