Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms