Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms