Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tgfbr3lD3YZZ2 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tgfbr3lD3YZZ2 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tgfbr3lD3YZZ2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tgfbr3lD3YZZ2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Tgfbr3lD3YZZ2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Tgfbr3lD3YZZ2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Tgfbr3lD3YZZ2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Tgfbr3lD3YZZ2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms