Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms