Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc13D3YV10 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms