Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms