Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20547B8JJN0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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