Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp26c1B2RXA7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyp26c1B2RXA7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms