Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usf3B2RUQ2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms