Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4787B2RUD9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gm4787B2RUD9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gm4787B2RUD9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm4787B2RUD9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm4787B2RUD9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm4787B2RUD9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm4787B2RUD9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gm4787B2RUD9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gm4787B2RUD9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gm4787B2RUD9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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