Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrt4B2RU40 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt4B2RU40 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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