Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ythdc2B2RR83 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms