Protein–RNA interactions for Protein: B1AZ99

Otud3, OTU domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud3B1AZ99 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud3B1AZ99 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms