Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CK137956B1AYM9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms