Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ssxb8B1AY40 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ssxb8B1AY40 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ssxb8B1AY40 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ssxb8B1AY40 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ssxb8B1AY40 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ssxb8B1AY40 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Ssxb8B1AY40 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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