Protein–RNA interactions for Protein: B1AX85

6030498E09Rik, RIKEN cDNA 6030498E09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030498E09RikB1AX85 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6030498E09RikB1AX85 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6030498E09RikB1AX85 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6030498E09RikB1AX85 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
6030498E09RikB1AX85 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6030498E09RikB1AX85 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6030498E09RikB1AX85 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6030498E09RikB1AX85 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
6030498E09RikB1AX85 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
6030498E09RikB1AX85 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6030498E09RikB1AX85 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6030498E09RikB1AX85 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6030498E09RikB1AX85 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6030498E09RikB1AX85 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6030498E09RikB1AX85 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6030498E09RikB1AX85 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6030498E09RikB1AX85 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
6030498E09RikB1AX85 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
6030498E09RikB1AX85 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
6030498E09RikB1AX85 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
6030498E09RikB1AX85 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
6030498E09RikB1AX85 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6030498E09RikB1AX85 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6030498E09RikB1AX85 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6030498E09RikB1AX85 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms