Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap3aB1AWZ3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms