Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem235B1AQL3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms