Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms