Protein–RNA interactions for Protein: A7XV07

Skint8, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint8A7XV07 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skint8A7XV07 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms