Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms