Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Odf2A3KGV1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms