Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atp8b5A3FIN4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Atp8b5A3FIN4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b5A3FIN4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Atp8b5A3FIN4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Atp8b5A3FIN4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Atp8b5A3FIN4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Atp8b5A3FIN4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b5A3FIN4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Atp8b5A3FIN4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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