Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms