Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700023F06RikA2AB62 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700023F06RikA2AB62 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms