Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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Prdm16A2A935 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prdm16A2A935 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm16A2A935 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms