Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramef6A2A8M8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef6A2A8M8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms