Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp1bA1Z198 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms