Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms