Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms