Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE3

Trbv15, T cell receptor beta, variable 15 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv15A0A0A6YYE3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv15A0A0A6YYE3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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