Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YVX8

Ighv5-2, Immunoglobulin heavy variable 5-2 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-2A0A0A6YVX8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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