Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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