Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPROQ16827 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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PTPROQ16827 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPROQ16827 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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PTPROQ16827 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPROQ16827 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPROQ16827 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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PTPROQ16827 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPROQ16827 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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PTPROQ16827 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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PTPROQ16827 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
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PTPROQ16827 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPROQ16827 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPROQ16827 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPROQ16827 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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PTPROQ16827 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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PTPROQ16827 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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PTPROQ16827 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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