Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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RTN1Q16799 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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RTN1Q16799 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RTN1Q16799 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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RTN1Q16799 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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RTN1Q16799 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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RTN1Q16799 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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