Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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SNAPC1Q16533 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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SNAPC1Q16533 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
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SNAPC1Q16533 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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SNAPC1Q16533 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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