Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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SNAPC1Q16533 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
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SNAPC1Q16533 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNAPC1Q16533 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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