Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
RPE65Q16518 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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RPE65Q16518 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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RPE65Q16518 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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RPE65Q16518 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RPE65Q16518 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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RPE65Q16518 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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RPE65Q16518 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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