Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SNCBQ16143 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SNCBQ16143 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.1 ms