Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.63□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPTX1Q15818 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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NPTX1Q15818 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NPTX1Q15818 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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