Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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SMAD1Q15797 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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SMAD1Q15797 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMAD1Q15797 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMAD1Q15797 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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