Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL19A1Q14993 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL19A1Q14993 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL19A1Q14993 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
COL19A1Q14993 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL19A1Q14993 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL19A1Q14993 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL19A1Q14993 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL19A1Q14993 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL19A1Q14993 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL19A1Q14993 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL19A1Q14993 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL19A1Q14993 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL19A1Q14993 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
COL19A1Q14993 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
COL19A1Q14993 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL19A1Q14993 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL19A1Q14993 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL19A1Q14993 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
COL19A1Q14993 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL19A1Q14993 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL19A1Q14993 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
COL19A1Q14993 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
COL19A1Q14993 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.55□□□□□ -2
COL19A1Q14993 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL19A1Q14993 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL19A1Q14993 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
COL19A1Q14993 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL19A1Q14993 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL19A1Q14993 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL19A1Q14993 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL19A1Q14993 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
COL19A1Q14993 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
COL19A1Q14993 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL19A1Q14993 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL19A1Q14993 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL19A1Q14993 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL19A1Q14993 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL19A1Q14993 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL19A1Q14993 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL19A1Q14993 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
COL19A1Q14993 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
COL19A1Q14993 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL19A1Q14993 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
COL19A1Q14993 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL19A1Q14993 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL19A1Q14993 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL19A1Q14993 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL19A1Q14993 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
COL19A1Q14993 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
COL19A1Q14993 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
COL19A1Q14993 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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COL19A1Q14993 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL19A1Q14993 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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