Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
C1DQ13901 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
C1DQ13901 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
C1DQ13901 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
C1DQ13901 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
C1DQ13901 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
C1DQ13901 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
C1DQ13901 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
C1DQ13901 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
C1DQ13901 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
C1DQ13901 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
C1DQ13901 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
C1DQ13901 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
C1DQ13901 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
C1DQ13901 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
C1DQ13901 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
C1DQ13901 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
C1DQ13901 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
C1DQ13901 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
C1DQ13901 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
C1DQ13901 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
C1DQ13901 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
C1DQ13901 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
C1DQ13901 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
C1DQ13901 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
C1DQ13901 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
C1DQ13901 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
C1DQ13901 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
C1DQ13901 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
C1DQ13901 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
C1DQ13901 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
C1DQ13901 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
C1DQ13901 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
C1DQ13901 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
C1DQ13901 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
C1DQ13901 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
C1DQ13901 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
C1DQ13901 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
C1DQ13901 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
C1DQ13901 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
C1DQ13901 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
C1DQ13901 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
C1DQ13901 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
C1DQ13901 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
C1DQ13901 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
C1DQ13901 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
C1DQ13901 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
C1DQ13901 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
C1DQ13901 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
C1DQ13901 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
C1DQ13901 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
C1DQ13901 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
C1DQ13901 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
C1DQ13901 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
C1DQ13901 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
C1DQ13901 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
C1DQ13901 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
C1DQ13901 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
C1DQ13901 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
C1DQ13901 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
C1DQ13901 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
C1DQ13901 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
C1DQ13901 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
C1DQ13901 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
C1DQ13901 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
C1DQ13901 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
C1DQ13901 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
C1DQ13901 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
C1DQ13901 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
C1DQ13901 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
C1DQ13901 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
C1DQ13901 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
C1DQ13901 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
C1DQ13901 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
C1DQ13901 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
C1DQ13901 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
C1DQ13901 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
C1DQ13901 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
C1DQ13901 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
C1DQ13901 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
C1DQ13901 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
C1DQ13901 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
C1DQ13901 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
C1DQ13901 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
C1DQ13901 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
C1DQ13901 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
C1DQ13901 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
C1DQ13901 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
C1DQ13901 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
C1DQ13901 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
C1DQ13901 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
C1DQ13901 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
C1DQ13901 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
C1DQ13901 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
C1DQ13901 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
C1DQ13901 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
C1DQ13901 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
C1DQ13901 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
C1DQ13901 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
C1DQ13901 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228 ms