Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-2.14□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC-2.15□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC-2.15□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
SPTAN1Q13813 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-2.18□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-2.19□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-2.19□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC-2.19□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
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