Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MSLNQ13421 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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