Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MTA1Q13330 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MTA1Q13330 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.2 ms