Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GRIK2Q13002 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GRIK2Q13002 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GRIK2Q13002 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
GRIK2Q13002 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GRIK2Q13002 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK2Q13002 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK2Q13002 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK2Q13002 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK2Q13002 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK2Q13002 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK2Q13002 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK2Q13002 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK2Q13002 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK2Q13002 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK2Q13002 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK2Q13002 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK2Q13002 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK2Q13002 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK2Q13002 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK2Q13002 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK2Q13002 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIK2Q13002 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIK2Q13002 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
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