Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CHD3Q12873 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CHD3Q12873 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
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