Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TSPOP30536 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TSPOP30536 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TSPOP30536 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TSPOP30536 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TSPOP30536 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TSPOP30536 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TSPOP30536 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
TSPOP30536 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TSPOP30536 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TSPOP30536 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TSPOP30536 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TSPOP30536 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TSPOP30536 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TSPOP30536 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TSPOP30536 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TSPOP30536 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TSPOP30536 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TSPOP30536 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TSPOP30536 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TSPOP30536 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TSPOP30536 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TSPOP30536 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TSPOP30536 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TSPOP30536 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TSPOP30536 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TSPOP30536 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TSPOP30536 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TSPOP30536 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
TSPOP30536 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TSPOP30536 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TSPOP30536 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TSPOP30536 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TSPOP30536 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TSPOP30536 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TSPOP30536 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TSPOP30536 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TSPOP30536 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TSPOP30536 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TSPOP30536 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TSPOP30536 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TSPOP30536 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TSPOP30536 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TSPOP30536 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TSPOP30536 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TSPOP30536 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TSPOP30536 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TSPOP30536 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TSPOP30536 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TSPOP30536 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TSPOP30536 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TSPOP30536 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TSPOP30536 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TSPOP30536 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TSPOP30536 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TSPOP30536 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TSPOP30536 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TSPOP30536 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TSPOP30536 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TSPOP30536 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TSPOP30536 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TSPOP30536 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TSPOP30536 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TSPOP30536 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TSPOP30536 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TSPOP30536 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
TSPOP30536 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TSPOP30536 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TSPOP30536 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TSPOP30536 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TSPOP30536 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TSPOP30536 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TSPOP30536 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TSPOP30536 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
TSPOP30536 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TSPOP30536 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TSPOP30536 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TSPOP30536 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TSPOP30536 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TSPOP30536 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TSPOP30536 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TSPOP30536 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.68□□□□□ -2.52
TSPOP30536 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TSPOP30536 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TSPOP30536 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TSPOP30536 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TSPOP30536 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TSPOP30536 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TSPOP30536 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TSPOP30536 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TSPOP30536 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TSPOP30536 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TSPOP30536 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TSPOP30536 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TSPOP30536 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
TSPOP30536 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TSPOP30536 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
TSPOP30536 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TSPOP30536 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TSPOP30536 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms