Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VDRP11473 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VDRP11473 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VDRP11473 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.71□□□□□ -2.3
VDRP11473 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VDRP11473 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VDRP11473 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VDRP11473 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VDRP11473 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VDRP11473 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VDRP11473 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VDRP11473 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VDRP11473 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VDRP11473 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VDRP11473 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VDRP11473 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VDRP11473 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VDRP11473 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VDRP11473 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VDRP11473 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VDRP11473 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VDRP11473 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VDRP11473 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VDRP11473 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VDRP11473 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VDRP11473 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VDRP11473 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VDRP11473 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VDRP11473 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VDRP11473 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VDRP11473 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VDRP11473 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VDRP11473 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VDRP11473 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VDRP11473 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VDRP11473 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
VDRP11473 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VDRP11473 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VDRP11473 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VDRP11473 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VDRP11473 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VDRP11473 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VDRP11473 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VDRP11473 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VDRP11473 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VDRP11473 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VDRP11473 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VDRP11473 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VDRP11473 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VDRP11473 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VDRP11473 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VDRP11473 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VDRP11473 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VDRP11473 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VDRP11473 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VDRP11473 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VDRP11473 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VDRP11473 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VDRP11473 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VDRP11473 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VDRP11473 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VDRP11473 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VDRP11473 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VDRP11473 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VDRP11473 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VDRP11473 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VDRP11473 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VDRP11473 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VDRP11473 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VDRP11473 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VDRP11473 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
VDRP11473 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VDRP11473 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VDRP11473 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VDRP11473 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VDRP11473 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VDRP11473 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VDRP11473 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VDRP11473 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VDRP11473 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VDRP11473 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VDRP11473 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VDRP11473 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VDRP11473 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VDRP11473 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VDRP11473 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VDRP11473 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VDRP11473 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VDRP11473 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VDRP11473 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VDRP11473 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VDRP11473 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VDRP11473 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VDRP11473 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VDRP11473 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
VDRP11473 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
VDRP11473 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
VDRP11473 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
VDRP11473 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
VDRP11473 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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